首页 编程教程正文

python实现批量nii文件转换为png图像

piaodoo 编程教程 2020-02-02 11:56:17 1289 0 python教程

这篇文章主要介绍了python实现批量nii文件转换为png图像,文中通过示例代码介绍的非常详细,对大家的学习或者工作具有一定的参考学习价值,需要的朋友们下面随着小编来一起学习学习吧

之前介绍过单个nii文件转换成png图像:

https://www.jb51.net/article/165693.htm

这里介绍将多个nii文件(保存在一个文件夹下)转换成png图像。且图像单个文件夹的名称与nii名字相同。

import numpy as np
import os    #遍历文件夹
import nibabel as nib #nii格式一般都会用到这个包
import imageio   #转换成图像
 
def nii_to_image(niifile):
 filenames = os.listdir(filepath) #读取nii文件夹
 slice_trans = []
 
 for f in filenames:
  #开始读取nii文件
  img_path = os.path.join(filepath, f)
  img = nib.load(img_path)    #读取nii
  img_fdata = img.get_fdata()
  fname = f.replace('.nii','')   #去掉nii的后缀名
  img_f_path = os.path.join(imgfile, fname)
  #创建nii对应的图像的文件夹
  if not os.path.exists(img_f_path):
   os.mkdir(img_f_path)    #新建文件夹
 
  #开始转换为图像
  (x,y,z) = img.shape
  for i in range(z):      #z是图像的序列
   silce = img_fdata[i, :, :]   #选择哪个方向的切片都可以
   imageio.imwrite(os.path.join(img_f_path,'{}.png'.format(i)), silce)
            #保存图像
 
if __name__ == '__main__':
 filepath = 'nii的文件夹'
 imgfile = 'image的文件夹'
 nii_to_image(filepath)

代码是我自己写的,用于处理ADNI的nii格式完全有效。

以上就是本文的全部内容,希望对大家的学习有所帮助,也希望大家多多支持脚本之家。

版权声明:

本站所有资源均为站长或网友整理自互联网或站长购买自互联网,站长无法分辨资源版权出自何处,所以不承担任何版权以及其他问题带来的法律责任,如有侵权或者其他问题请联系站长删除!站长QQ754403226 谢谢。

有关影视版权:本站只供百度云网盘资源,版权均属于影片公司所有,请在下载后24小时删除,切勿用于商业用途。本站所有资源信息均从互联网搜索而来,本站不对显示的内容承担责任,如您认为本站页面信息侵犯了您的权益,请附上版权证明邮件告知【754403226@qq.com】,在收到邮件后72小时内删除。本文链接:https://www.piaodoo.com/419.html

搜索